A diarreia crônica, ou recorrente, ocorre quando as evacuações acontecem em uma frequência igual ou maior a três vezes por dia, com fezes de aspecto amolecido ou aquoso, por um período superior a duas semanas.

O tratamento dependerá, claro, da(s) causa(s). Se, por exemplo, for alergia/intolerância a algum grupo alimentar, é preciso suspender o consumo do item nocivo para devolver normalidade ao organismo. Em alguns casos, como em pacientes contaminados pela bactéria Clostridium difficile, uma das mais difíceis de se curar, o transplante fecal pode ser uma solução.

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